Pappilan navetta palveli alun perin, nimensä mukaisesti, vuonna 1900 valmistuneen pappilan navettana. Sittemmin rakennuksessa on toiminut seurakunnan päiväkerho, sekä Karkkilan kaupungin esiopetus- ja erityisopetusryhmiä.

Tällä hetkellä Pappilan navetassa on pääasiassa seurakunnan perhe- ja päiväkerhoja, alakoululaisten iltapäiväkerhoja sekä nuorteniltoja.