Pappilan navetta palveli alun perin, nimensä mukaisesti, vuonna 1900 valmistuneen pappilan navettana. Sittemmin rakennuksessa on toiminut seurakunnan päiväkerho, sekä Karkkilan kaupungin esiopetus- ja erityisopetusryhmiä. Syksystä 2019 lähtien pappilan navetassa toimivat Karkkilan seurakunnan varhaiskasvatuksen kerhot.